В 1986 году была разработана военная версия самолёта ATR.42 (совместный проект фирмы Аэроспециале и итальянской Аэриталия) – АТМ42L. Машины этой версии имели большой грузовой люк (2.25х2.75 м) по левому борту и были способны перевозить до 38 солдат с личным снаряжением, 44 парашютистов или до 27 носилочных раненых. Для десантирования парашютистов в хвостовой части фюзеляжа имелись боковые двери. Ожидалось, что дальность полёта АТМ42L составит от 1000 км (с максимальной десантной нагрузкой в 5.3 тонны) до 4000 км (с грузом в 3.0 тонны). Самолёт оснащался двумя ТВД мощностью по 1800 э.л.с. и был способен развивать скорость до 500 км/ч. Его МВМ составляла 16.5 тонны. Планировалось закупить 25 самолётов данного типа для нужд ВВС Франции, однако этого так и не случилось.